Esto evita que Zotero intente leer o escribir en cualquier unidad externa durante la sincronización.
Aquí es donde se define la ubicación de los archivos adjuntos. Verás una opción que dice: como se desactiva el almacenamiento usb zotero
Si después de todo sigues viendo mensajes relacionados con USB, la solución más drástica pero efectiva es sin perder tus referencias. Esto evita que Zotero intente leer o escribir